В то время, готовясь к войне с Советским Туркестаном, бухарский эмир сформировал армию численностью до 40 тыс. человек. По инициативе и под руководством Бухарской компартии формировались боевые дружины, отряды и полки, собирались силы для борьбы против эмира. Одновременно коммунисты Бухары готовили вооруженное восстание внутри Бухарского эмирата.

По решению IV съезда компартии Бухары восстание было начато в конце августа 1920 г. Оно быстро охватило основные районы эмирата. Восставшие обратились за помощью к советскому командованию. Реввоенсовет Туркестанского фронта направил на помощь восставшим части Красной Армии под командованием М. В. Фрунзе. Количественное превосходство было на стороне войск эмира, но по морально-боевым качествам, боеспособности и техническому оснащению революционные бухарские отряды и части Красной Армии значительно превосходили противника. Армия бухарского эмира была разгромлена.